Files
reproduce_setup/pgx-main/pgx_fulgent_panel.tsv

177 lines
4.2 KiB
Plaintext

gene variants focused_panel covered
BCHE rs1803274 True True
BCHE rs1799807 True True
CYP2B6 *1 True True
CYP2B6 *4 True True
CYP2B6 *5 True True
CYP2B6 *6 True True
CYP2B6 *7 True True
CYP2B6 *8 True True
CYP2B6 *9 True True
CYP2B6 *13 True True
CYP2B6 *16 True True
CYP2B6 *18 True True
CYP2B6 *22 True True
CYP2C19 *1 True True
CYP2C19 *2 True True
CYP2C19 *3 True True
CYP2C19 *4 True True
CYP2C19 *5 True True
CYP2C19 *6 True True
CYP2C19 *7 True True
CYP2C19 *8 True True
CYP2C19 *9 True True
CYP2C19 *10 True True
CYP2C19 *17 True True
CYP2C19 *35 True True
CYP2C9 *1 True True
CYP2C9 *2 True True
CYP2C9 *3 True True
CYP2C9 *5 True True
CYP2C9 *6 True True
CYP2C9 *8 True True
CYP2C9 *11 True True
CYP2D6 *1 True True
CYP2D6 *1x2 True True
CYP2D6 *2 True True
CYP2D6 *2x2 True True
CYP2D6 *3 True True
CYP2D6 *4 True True
CYP2D6 *4x2 True True
CYP2D6 *5 True True
CYP2D6 *6 True True
CYP2D6 *7 True True
CYP2D6 *8 True True
CYP2D6 *9 True True
CYP2D6 *10 True True
CYP2D6 *10x2 True True
CYP2D6 *11 True True
CYP2D6 *12 True True
CYP2D6 *14 True True
CYP2D6 *15 True True
CYP2D6 *17 True True
CYP2D6 *19 True True
CYP2D6 *20 True True
CYP2D6 *21 True True
CYP2D6 *29 True True
CYP2D6 *31 True True
CYP2D6 *35 True True
CYP2D6 *36 True True
CYP2D6 *36x2 True True
CYP2D6 *40 True True
CYP2D6 *41 True True
CYP2D6 *45 True True
CYP2D6 *46 True True
CYP3A5 *1 True True
CYP3A5 *3 True True
CYP3A5 *6 True True
CYP3A5 *7 True True
CYP4F2 rs2108622 True True
DPYD *1 True True
DPYD *2A True False
DPYD *13 True True
DPYD rs67376798 True True
G6PD rs5030868 True True
G6PD rs1050829 True True
G6PD rs1050828 True True
HLA-B *15:02 True True
HLA-B *57:01 True True
IFNL4 rs12979860 True True
NAT2 *4 True False
NAT2 *5 True True
NAT2 *6 True True
NAT2 *7 True True
NAT2 *14 True True
RYRI rs118192177 True True
RYRI rs118192176 True True
RYRI rs193922762 True True
RYRI rs118192175 True True
RYRI rs193922770 True True
RYRI rs118192124 True True
RYRI rs193922832 True True
RYRI rs193922809 True True
RYRI rs193922802 True True
RYRI rs193922816 True True
RYRI rs112563513 True True
RYRI rs193922748 True True
RYRI rs118192161 True True
RYRI rs121918595 True True
RYRI rs121918596 True True
RYRI rs28933397 True True
RYRI rs193922753 True True
RYRI rs118192178 True True
RYRI rs28933396 True True
RYRI rs121918593 True True
RYRI rs193922843 True True
RYRI rs1801086 True True
RYRI rs144336148 True True
RYRI rs118192162 True True
RYRI rs193922768 True True
RYRI rs193922807 True True
RYRI rs118192116 True True
RYRI rs193922747 True True
RYRI rs118192122 True True
RYRI rs121918592 True True
RYRI rs118192168 True True
RYRI rs121918594 True True
RYRI rs118192172 True True
RYRI rs118192170 True True
RYRI rs111888148 True True
RYRI rs193922878 True True
RYRI rs193922876 True True
RYRI rs193922764 True True
RYRI rs193922772 True True
RYRI rs118192167 True True
RYRI rs193922818 True True
RYRI rs193922803 True True
RYRI rs63749869 True True
RYRI rs118192163 True True
NUDT15 *1 True True
NUDT15 *2 True True
NUDT15 *3 True True
NUDT15 *6 True True
NUDT15 *9 True True
SLCO1B1 rs4149056 True True
TPMT *1 True True
TPMT *2 True True
TPMT *3A True True
TPMT *3B True True
TPMT *3C True True
TPMT *4 True True
UGT1A1 *6 True True
UGT1A1 *80 True True
VKORC1 rs9923231 True True
ABCB1 rs2032582 False True
ABCB1 rs1045642 False True
ACE rs1799752 False True
ACE rs4343 False True
ANKK1 rs1800497 False True
APOE rs7412 False True
ATM rs11212617 False False
CES1 rs71647871 False True
COMT rs4680 False True
COMT rs13306278 False True
CYP2C8 rs10509681 False True
CYP3A4 rs2740574 False True
CYP3A4 rs2242480 False True
DRD2 rs1799978 False True
ERCC1 rs3212986 False True
ERCC1 rs11615 False True
F2 rs1799963 False True
F5 rs6025 False True
GGCX rs11676382 False True
GRIK4 rs1954787 False True
GSTP1 rs1695 False True
HTR1A rs6295 False True
HTR2A rs7997012 False True
HTR2C rs1414334 False True
HTR2C rs3813929 False True
ITPA rs1127354 False True
ITPA rs7270101 False True
KIF6 rs20455 False True
MTHFR rs1801133 False True
NQO1 rs1800566 False True
OPRM1 rs1799971 False True
UGT1A4 rs2011425 False True
XRCC1 rs25487 False True