reproduce_setup/pgx-main/pgx_fulgent_panel.tsv

1	gene	variants	focused_panel	covered
2	BCHE	rs1803274	True	True
3	BCHE	rs1799807	True	True
4	CYP2B6	*1	True	True
5	CYP2B6	*4	True	True
6	CYP2B6	*5	True	True
7	CYP2B6	*6	True	True
8	CYP2B6	*7	True	True
9	CYP2B6	*8	True	True
10	CYP2B6	*9	True	True
11	CYP2B6	*13	True	True
12	CYP2B6	*16	True	True
13	CYP2B6	*18	True	True
14	CYP2B6	*22	True	True
15	CYP2C19	*1	True	True
16	CYP2C19	*2	True	True
17	CYP2C19	*3	True	True
18	CYP2C19	*4	True	True
19	CYP2C19	*5	True	True
20	CYP2C19	*6	True	True
21	CYP2C19	*7	True	True
22	CYP2C19	*8	True	True
23	CYP2C19	*9	True	True
24	CYP2C19	*10	True	True
25	CYP2C19	*17	True	True
26	CYP2C19	*35	True	True
27	CYP2C9	*1	True	True
28	CYP2C9	*2	True	True
29	CYP2C9	*3	True	True
30	CYP2C9	*5	True	True
31	CYP2C9	*6	True	True
32	CYP2C9	*8	True	True
33	CYP2C9	*11	True	True
34	CYP2D6	*1	True	True
35	CYP2D6	*1x2	True	True
36	CYP2D6	*2	True	True
37	CYP2D6	*2x2	True	True
38	CYP2D6	*3	True	True
39	CYP2D6	*4	True	True
40	CYP2D6	*4x2	True	True
41	CYP2D6	*5	True	True
42	CYP2D6	*6	True	True
43	CYP2D6	*7	True	True
44	CYP2D6	*8	True	True
45	CYP2D6	*9	True	True
46	CYP2D6	*10	True	True
47	CYP2D6	*10x2	True	True
48	CYP2D6	*11	True	True
49	CYP2D6	*12	True	True
50	CYP2D6	*14	True	True
51	CYP2D6	*15	True	True
52	CYP2D6	*17	True	True
53	CYP2D6	*19	True	True
54	CYP2D6	*20	True	True
55	CYP2D6	*21	True	True
56	CYP2D6	*29	True	True
57	CYP2D6	*31	True	True
58	CYP2D6	*35	True	True
59	CYP2D6	*36	True	True
60	CYP2D6	*36x2	True	True
61	CYP2D6	*40	True	True
62	CYP2D6	*41	True	True
63	CYP2D6	*45	True	True
64	CYP2D6	*46	True	True
65	CYP3A5	*1	True	True
66	CYP3A5	*3	True	True
67	CYP3A5	*6	True	True
68	CYP3A5	*7	True	True
69	CYP4F2	rs2108622	True	True
70	DPYD	*1	True	True
71	DPYD	*2A	True	False
72	DPYD	*13	True	True
73	DPYD	rs67376798	True	True
74	G6PD	rs5030868	True	True
75	G6PD	rs1050829	True	True
76	G6PD	rs1050828	True	True
77	HLA-B	*15:02	True	True
78	HLA-B	*57:01	True	True
79	IFNL4	rs12979860	True	True
80	NAT2	*4	True	False
81	NAT2	*5	True	True
82	NAT2	*6	True	True
83	NAT2	*7	True	True
84	NAT2	*14	True	True
85	RYRI	rs118192177	True	True
86	RYRI	rs118192176	True	True
87	RYRI	rs193922762	True	True
88	RYRI	rs118192175	True	True
89	RYRI	rs193922770	True	True
90	RYRI	rs118192124	True	True
91	RYRI	rs193922832	True	True
92	RYRI	rs193922809	True	True
93	RYRI	rs193922802	True	True
94	RYRI	rs193922816	True	True
95	RYRI	rs112563513	True	True
96	RYRI	rs193922748	True	True
97	RYRI	rs118192161	True	True
98	RYRI	rs121918595	True	True
99	RYRI	rs121918596	True	True
100	RYRI	rs28933397	True	True
101	RYRI	rs193922753	True	True
102	RYRI	rs118192178	True	True
103	RYRI	rs28933396	True	True
104	RYRI	rs121918593	True	True
105	RYRI	rs193922843	True	True
106	RYRI	rs1801086	True	True
107	RYRI	rs144336148	True	True
108	RYRI	rs118192162	True	True
109	RYRI	rs193922768	True	True
110	RYRI	rs193922807	True	True
111	RYRI	rs118192116	True	True
112	RYRI	rs193922747	True	True
113	RYRI	rs118192122	True	True
114	RYRI	rs121918592	True	True
115	RYRI	rs118192168	True	True
116	RYRI	rs121918594	True	True
117	RYRI	rs118192172	True	True
118	RYRI	rs118192170	True	True
119	RYRI	rs111888148	True	True
120	RYRI	rs193922878	True	True
121	RYRI	rs193922876	True	True
122	RYRI	rs193922764	True	True
123	RYRI	rs193922772	True	True
124	RYRI	rs118192167	True	True
125	RYRI	rs193922818	True	True
126	RYRI	rs193922803	True	True
127	RYRI	rs63749869	True	True
128	RYRI	rs118192163	True	True
129	NUDT15	*1	True	True
130	NUDT15	*2	True	True
131	NUDT15	*3	True	True
132	NUDT15	*6	True	True
133	NUDT15	*9	True	True
134	SLCO1B1	rs4149056	True	True
135	TPMT	*1	True	True
136	TPMT	*2	True	True
137	TPMT	*3A	True	True
138	TPMT	*3B	True	True
139	TPMT	*3C	True	True
140	TPMT	*4	True	True
141	UGT1A1	*6	True	True
142	UGT1A1	*80	True	True
143	VKORC1	rs9923231	True	True
144	ABCB1	rs2032582	False	True
145	ABCB1	rs1045642	False	True
146	ACE	rs1799752	False	True
147	ACE	rs4343	False	True
148	ANKK1	rs1800497	False	True
149	APOE	rs7412	False	True
150	ATM	rs11212617	False	False
151	CES1	rs71647871	False	True
152	COMT	rs4680	False	True
153	COMT	rs13306278	False	True
154	CYP2C8	rs10509681	False	True
155	CYP3A4	rs2740574	False	True
156	CYP3A4	rs2242480	False	True
157	DRD2	rs1799978	False	True
158	ERCC1	rs3212986	False	True
159	ERCC1	rs11615	False	True
160	F2	rs1799963	False	True
161	F5	rs6025	False	True
162	GGCX	rs11676382	False	True
163	GRIK4	rs1954787	False	True
164	GSTP1	rs1695	False	True
165	HTR1A	rs6295	False	True
166	HTR2A	rs7997012	False	True
167	HTR2C	rs1414334	False	True
168	HTR2C	rs3813929	False	True
169	ITPA	rs1127354	False	True
170	ITPA	rs7270101	False	True
171	KIF6	rs20455	False	True
172	MTHFR	rs1801133	False	True
173	NQO1	rs1800566	False	True
174	OPRM1	rs1799971	False	True
175	UGT1A4	rs2011425	False	True
176	XRCC1	rs25487	False	True